Bioinformatics Programming Using Python. Practical Programming for Biological Data
![Język publikacji: angielski Język publikacji: angielski](https://static01.helion.com.pl/global/flagi/1.png)
- Autor:
- Mitchell L Model
![Bioinformatics Programming Using Python. Practical Programming for Biological Data Mitchell L Model - okładka ebooka](https://static01.helion.com.pl/global/okladki/326x466/e_2g75.png)
![Bioinformatics Programming Using Python. Practical Programming for Biological Data Mitchell L Model - tył okładki ebooka](https://static01.helion.com.pl/global/okladki-tyl/326x466/e_2g75.png)
- Ocena:
- Bądź pierwszym, który oceni tę książkę
- Stron:
- 524
- Dostępne formaty:
-
ePubMobi
Opis ebooka: Bioinformatics Programming Using Python. Practical Programming for Biological Data
Powerful, flexible, and easy to use, Python is an ideal language for building software tools and applications for life science research and development. This unique book shows you how to program with Python, using code examples taken directly from bioinformatics. In a short time, you'll be using sophisticated techniques and Python modules that are particularly effective for bioinformatics programming.
Bioinformatics Programming Using Python is perfect for anyone involved with bioinformatics -- researchers, support staff, students, and software developers interested in writing bioinformatics applications. You'll find it useful whether you already use Python, write code in another language, or have no programming experience at all. It's an excellent self-instruction tool, as well as a handy reference when facing the challenges of real-life programming tasks.
- Become familiar with Python's fundamentals, including ways to develop simple applications
- Learn how to use Python modules for pattern matching, structured text processing, online data retrieval, and database access
- Discover generalized patterns that cover a large proportion of how Python code is used in bioinformatics
- Learn how to apply the principles and techniques of object-oriented programming
- Benefit from the "tips and traps" section in each chapter
Wybrane bestsellery
-
Dzięki tej książce dowiesz się, jak pozyskiwać, analizować i wizualizować dane, a potem używać ich do rozwiązywania problemów biznesowych. Wystarczy, że znasz podstawy Pythona i matematyki na poziomie liceum, aby zacząć stosować naukę o danych w codziennej pracy. Znajdziesz tu szereg praktycznych...
Data science i Python. Stawianie czoła najtrudniejszym wyzwaniom biznesowym Data science i Python. Stawianie czoła najtrudniejszym wyzwaniom biznesowym
(48.30 zł najniższa cena z 30 dni)44.85 zł
69.00 zł(-35%) -
Pytest – nowoczesny framework do uruchamiania testów automatycznych w języku Python. Można używać tej platformy do przeprowadzania testów jednostkowych, ale sprawdzi się świetnie także podczas konstruowania rozbudowanych testów wyższego poziomu (integracyjnych, end-to-end) dla całych aplika...
Pytest. Kurs video. Automatyzacja testów w Pythonie Pytest. Kurs video. Automatyzacja testów w Pythonie
(81.95 zł najniższa cena z 30 dni)67.05 zł
149.00 zł(-55%) -
Oto zaktualizowane wydanie popularnego przewodnika, dzięki któremu skorzystasz z ponad dwustu sprawdzonych receptur bazujących na najnowszych wydaniach bibliotek Pythona. Wystarczy, że skopiujesz i dostosujesz kod do swoich potrzeb. Możesz też go uruchamiać i testować za pomocą przykładowego zbio...
Uczenie maszynowe w Pythonie. Receptury. Od przygotowania danych do deep learningu. Wydanie II Uczenie maszynowe w Pythonie. Receptury. Od przygotowania danych do deep learningu. Wydanie II
(53.40 zł najniższa cena z 30 dni)57.84 zł
89.00 zł(-35%) -
Sposobów na naukę Pythona jest sporo i powstało na ten temat mnóstwo publikacji. Jeżeli ten wybór jest właśnie przed Tobą, rozważ naukę Pythona poprzez tworzenie prostych gier. Ich programowanie to nie tylko świetna zabawa, ale też doskonała metoda rozwijania umiejętności algorytmicznych, kreatyw...
Python od podstaw. Kurs video. Tworzenie pierwszych gier w PyCharm Python od podstaw. Kurs video. Tworzenie pierwszych gier w PyCharm
(51.60 zł najniższa cena z 30 dni)58.04 zł
129.00 zł(-55%) -
To trzecie, zaktualizowane i uzupełnione wydanie bestsellerowego podręcznika programowania w Pythonie. Naukę rozpoczniesz od podstawowych koncepcji programowania. Poznasz takie pojęcia jak zmienne, listy, klasy i pętle, a następnie utrwalisz je dzięki praktycznym ćwiczeniom. Dowiesz się, jak zape...(71.40 zł najniższa cena z 30 dni)
77.35 zł
119.00 zł(-35%) -
Głębokie sieci neuronowe mają niesamowity potencjał. Osiągnięcia ostatnich lat nadały procesom uczenia głębokiego zupełnie nową jakość. Obecnie nawet programiści niezaznajomieni z tą technologią mogą korzystać z prostych i niezwykle skutecznych narzędzi, pozwalających na sprawne implementowanie p...
Uczenie maszynowe z użyciem Scikit-Learn, Keras i TensorFlow. Wydanie III Uczenie maszynowe z użyciem Scikit-Learn, Keras i TensorFlow. Wydanie III
(107.40 zł najniższa cena z 30 dni)116.35 zł
179.00 zł(-35%) -
Ta książka stanowi przystępne wprowadzenie do świata projektantów i budowniczych robotów. Dzięki niej dowiesz się, jak wybrać potrzebne podzespoły, jak je ze sobą połączyć i jak wykorzystywać poszczególne urządzenia wejścia i wyjścia. Posłużysz się w tym celu płytką Raspberry Pi i kompatybilnymi ...
Jak zaprogramować robota. Zastosowanie Raspberry Pi i Pythona w tworzeniu autonomicznych robotów. Wydanie II Jak zaprogramować robota. Zastosowanie Raspberry Pi i Pythona w tworzeniu autonomicznych robotów. Wydanie II
(59.40 zł najniższa cena z 30 dni)64.35 zł
99.00 zł(-35%) -
Fachowcy z branży IT, by dobrze wykonywać swoją pracę, muszą w niej zwykle używać od kilku do kilkunastu narzędzi. Z drugiej strony nikt nie jest w stanie dobrze poznać nawet wycinka wszystkich technologii, języków programowania czy aplikacji, które powstają każdego roku. Czy wśród tego bogactwa,...
Receptura na Python. Kurs Video. 54 praktyczne porady dla programistów Receptura na Python. Kurs Video. 54 praktyczne porady dla programistów
(39.90 zł najniższa cena z 30 dni)89.54 zł
199.00 zł(-55%) -
Python to jeden z najpopularniejszych dynamicznych języków programowania. Nie od dziś znajduje on zastosowanie w różnych dziedzinach informatyki, zwłaszcza jako doskonały język skryptowy. Jeśli korzystasz z niego na co dzień i chcesz szybko wyszukiwać niezbędne informacje lub odświeżyć swoją wied...(8.49 zł najniższa cena z 30 dni)
8.49 zł
17.00 zł(-50%) -
Ta książka to sprawdzone źródło informacji na temat Pythona i jego najczęstszych zastosowań. Należy ona do cenionej serii „Receptury”, w której znajdziesz najlepsze sposoby rozwiązywania problemów. Przekonaj się, jak wydajnie operować na strukturach danych, łańcuchach znaków, tekście ...(9.90 zł najniższa cena z 30 dni)
49.50 zł
99.00 zł(-50%)
Ebooka "Bioinformatics Programming Using Python. Practical Programming for Biological Data" przeczytasz na:
-
czytnikach Inkbook, Kindle, Pocketbook, Onyx Boox i innych
-
systemach Windows, MacOS i innych
-
systemach Windows, Android, iOS, HarmonyOS
-
na dowolnych urządzeniach i aplikacjach obsługujących formaty: PDF, EPub, Mobi
Masz pytania? Zajrzyj do zakładki Pomoc »
Audiobooka "Bioinformatics Programming Using Python. Practical Programming for Biological Data" posłuchasz:
-
w aplikacji Ebookpoint na Android, iOS, HarmonyOs
-
na systemach Windows, MacOS i innych
-
na dowolnych urządzeniach i aplikacjach obsługujących format MP3 (pliki spakowane w ZIP)
Masz pytania? Zajrzyj do zakładki Pomoc »
Kurs Video "Bioinformatics Programming Using Python. Practical Programming for Biological Data" zobaczysz:
-
w aplikacjach Ebookpoint i Videopoint na Android, iOS, HarmonyOs
-
na systemach Windows, MacOS i innych z dostępem do najnowszej wersji Twojej przeglądarki internetowej
Szczegóły ebooka
- ISBN Ebooka:
- 978-14-493-8290-2, 9781449382902
- Data wydania ebooka:
-
2009-12-08
Data wydania ebooka często jest dniem wprowadzenia tytułu do sprzedaży i może nie być równoznaczna z datą wydania książki papierowej. Dodatkowe informacje możesz znaleźć w darmowym fragmencie. Jeśli masz wątpliwości skontaktuj się z nami sklep@ebookpoint.pl.
- Język publikacji:
- angielski
- Rozmiar pliku ePub:
- 3.1MB
- Rozmiar pliku Mobi:
- 8.4MB
Spis treści ebooka
- Bioinformatics Programming Using Python
- SPECIAL OFFER: Upgrade this ebook with OReilly
- A Note Regarding Supplemental Files
- Preface
- Introduction
- About This Book
- About Bioinformatics
- About the Reader
- Introduction
- Python
- Some Context
- The Python Language
- Installing Python
- Running Python
- Notes
- Reading and Reference Recommendations
- Example Code
- Unfortunate and Unavoidable Vocabulary Overlap
- Comments
- Conventions Used in This Book
- Wed Like to Hear from You
- Using Code Examples
- Safari Books Online
- Acknowledgments
- 1. Primitives
- Simple Values
- Booleans
- Integers
- Floats
- Strings
- Simple Values
- Expressions
- Numeric Operators
- Logical Operations
- String Operations
- String operators
- Subscription
- Slicing
- Calls
- Function calls
- Method calls
- Compound Expressions
- Tips, Traps, and Tracebacks
- Tips
- Statements and expressions
- Running Python interactively
- Tips
- Traps
- Tracebacks
- 2. Names, Functions, and Modules
- Assigning Names
- Defining Functions
- Function Parameters
- Comments and Documentation
- Assertions
- Default Parameter Values
- Using Modules
- Importing
- Module namespaces
- The random module
- Importing
- Python Files
- Tips, Traps, and Tracebacks
- Tips
- Names
- Function definitions
- Executing code
- Using IDLE
- Managing Python files
- Tips
- Traps
- Tracebacks
- 3. Collections
- Sets
- Sequences
- Strings, Bytes, and Bytearrays
- Creating
- Testing
- Searching
- Replacing
- Changing case
- Reformatting
- The format method and function
- Strings, Bytes, and Bytearrays
- Ranges
- Tuples
- Tuple syntax
- Tuple packing and unpacking
- Lists
- Statements that modify lists
- List modification methods
- Sequence-oriented string methods
- Mappings
- Dictionaries
- Dictionary example: RNA codon translation table
- Dictionary operations
- Dictionary methods
- Dictionaries
- Streams
- Files
- Creating file objects
- File methods
- Example
- Files
- Generators
- Collection-Related Expression Features
- Comprehensions
- List comprehensions
- Set and dictionary comprehensions
- Generator expressions
- Conditional comprehensions
- Nested comprehensions
- Comprehensions
- Functional Parameters
- The parameter key
- Function objects
- Anonymous functions
- Tips, Traps, and Tracebacks
- Tips
- Language features
- Developing and testing code
- Tips
- Traps
- Tracebacks
- 4. Control Statements
- Conditionals
- Loops
- Simple Loop Examples
- Initialization of Loop Values
- Looping Forever
- Loops with Guard Conditions
- Iterations
- Iteration Statements
- Kinds of Iterations
- Do
- Collect
- Combine
- Search
- Filter
- Nested iterations
- Recursive iterations
- Exception Handlers
- Python Errors
- Tracebacks
- Runtime errors
- Python Errors
- Exception Handling Statements
- Optional features of exception handling statements
- Exception handling and generator objects
- Raising Exceptions
- The raise statement
- Raising an exception to end a loop
- Extended Examples
- Extracting Information from an HTML File
- The Grand Unified Bioinformatics File Parser
- Reading the sequences in a FASTA file
- Generalized parsing
- Parsing GenBank Files
- Translating RNA Sequences
- Step 1
- Step 2
- Step 3
- Step 4
- Step 5
- Constructing a Table from a Text File
- Step 1
- Step 2
- Step 3
- Step 4
- Step 5
- Tips, Traps, and Tracebacks
- Tips
- Traps
- Tracebacks
- 5. Classes
- Defining Classes
- Instance Attributes
- Access methods
- Predicate methods
- Initialization methods
- String methods
- Modification methods
- Action methods
- Support methods
- Summary
- Instance Attributes
- Class Attributes
- Class fields
- Class methods
- Classes as objects
- Defining Classes
- Class and Method Relationships
- Decomposition
- Class decomposition
- Method decomposition
- Singleton classes
- Decomposition
- Inheritance
- Defining subclasses
- Factoring out common code
- Generalization
- Subclass methods
- Tips, Traps, and Tracebacks
- Tips
- Traps
- Tracebacks
- 6. Utilities
- System Environment
- Dates and Times: datetime
- Classes
- Instance creation
- Operations
- Methods
- Dates and Times: datetime
- System Information
- The Python runtime environment: sys
- The system clock: time
- System Environment
- Command-Line Utilities
- Reading multiple files: fileinput
- Command-line options: optparse
- Command-line commands: subprocess
- Communications
- Sending email: smtplib
- Logging: logging
- The Filesystem
- Operating System Interface: os
- Environment access
- Managing files and directories
- Directories
- Files
- Directory contents
- Temporary files: tempfile
- Operating System Interface: os
- Manipulating Paths: os.path
- Path components
- Path manipulations
- Path information
- Filename Expansion: fnmatch and glob
- fnmatch
- glob
- Shell Utilities: shutil
- Comparing Files and Directories
- File and directory comparison: filecmp
- Showing the differences between two files: difflib
- Working with Text
- Formatting Blocks of Text: textwrap
- String Utilities: string
- Comma- and Tab-Separated Formats: csv
- String-Based Reading and Writing: io
- Persistent Storage
- Persistent Text: dbm
- Persistent Objects: pickle
- Keyed Persistent Object Storage: shelve
- Debugging Tools
- The Python debugger: pdb
- The IDLE debugger
- Tips, Traps, and Tracebacks
- Tips
- Traps
- Tracebacks
- 7. Pattern Matching
- Fundamental Syntax
- Fixed-Length Matching
- Literal matches
- Character sets
- Character classes
- Boundaries
- Fixed-Length Matching
- Variable-Length Matching
- Repetition
- Fundamental Syntax
- Greedy Versus Nongreedy Matching
- Grouping and Disjunction
- The Actions of the re Module
- Functions
- Flags
- Methods
- Results of re Functions and Methods
- Match Object Fields
- Match Object Methods
- Putting It All Together: Examples
- Some Quick Examples
- Using regular expressions to ignore case
- Listing files in a directory, excluding some
- Finding open reading frames
- Some Quick Examples
- Extracting Descriptions from Sequence Files
- Extracting Entries From Sequence Files
- Using regular expressions to extract entries
- Keeping track of the position between calls
- Buffering input
- Tips, Traps, and Tracebacks
- Tips
- Traps
- Tracebacks
- 8. Structured Text
- HTML
- Simple HTML Processing
- Searching HTML text
- More elaborate HTML pattern matching
- Turning HTML into plain text
- Simple HTML Processing
- Structured HTML Processing
- Problems with HTML pattern matching
- Structured HTML parsing: html.parser
- HTML
- XML
- The Nature of XML
- An XML File for a Complete Genome
- The ElementTree Module
- Getting started with ElementTree
- Navigating around an ElementTree
- Event-Based Processing
- Function calls, exceptions, and the call stack
- Callbacks: Reversed function calls
- Programming for an event-based processor
- expat
- Obtaining a single piece of information
- Extracting a few pieces of data
- Getting the content of all tags with a specified name
- Tips, Traps, and Tracebacks
- Tips
- Traps
- Tracebacks
- 9. Web Programming
- Manipulating URLs: urllib.parse
- Disassembling URLs
- Assembling URLs
- Manipulating URLs: urllib.parse
- Opening Web Pages: webbrowser
- Module Functions
- Constructing and Submitting Queries
- Constructing and Viewing an HTML Page
- Web Clients
- Making the URLs in a Response Absolute
- Constructing an HTML Page of Extracted Links
- Downloading a Web Pages Linked Files
- Web Servers
- Sockets and Servers
- Server fundamentals
- Running a server: The http.server module
- Sockets and Servers
- CGI
- Serving CGI requests
- Setting up CGI
- CGI script arguments and responses
- Simple Web Applications
- Using CGI scripts
- HTML forms with CGI scripts
- Tips, Traps, and Tracebacks
- Tips
- Web pages
- Debugging CGI scripts
- HTTP servers
- Tips
- Traps
- Tracebacks
- 10. Relational Databases
- Representation in Relational Databases
- Database Tables
- Avoiding duplication of values
- Representation of relationships
- Database definition
- Database Tables
- A Restriction Enzyme Database
- The data
- Reading the data
- A schema for the Rebase database
- Representation in Relational Databases
- Using Relational Data
- SQL Basics
- Using the sqlite3 module
- Connecting to the database
- Creating the database
- Loading data into tables
- SQL Basics
- SQL Queries
- Simple database queries
- Qualified database queries
- Relationship queries
- Querying the Database from a Web Page
- HTML frames
- An HTML page of query forms
- Tips, Traps, and Tracebacks
- Tips
- Traps
- Tracebacks
- 11. Structured Graphics
- Introduction to Graphics Programming
- Concepts
- Coordinate system
- Components
- Properties
- Concepts
- GUI Toolkits
- GUI toolkits for Python
- Using a GUI toolkit
- Introduction to Graphics Programming
- Structured Graphics with tkinter
- tkinter Fundamentals
- The basic steps
- Common widget options
- Canvas drawing methods
- Writing the contents of a canvas to a PostScript file
- tkinter Fundamentals
- Examples
- An abstract class for tkinter graphics
- Dot plots
- Histograms
- Structured Graphics with SVG
- SVG File Contents
- SVG tags
- SVG styles
- SVG File Contents
- Examples
- Histograms of codon use
- Sequencing trace file curves using SVG
- Tips, Traps, and Tracebacks
- Tips
- Traps
- SVG traps
- Tracebacks
- A. Python Language Summary
- Language Components
- Special Syntactic Elements
- Keywords
- Special Names
- Operators
- Anonymous Functions
- Language Components
- Types and Expressions
- Statements
- Notes
- B. Collection Type Summary
- Types and General Operations
- Common Operations
- Creating Collections
- Types and General Operations
- Specific Collection Types
- Sets
- Sequences
- Strings
- Lists
- Mappings
- Streams
- File objects
- Generators
- Iteration Templates
- Basic Iteration Templates
- Filtering Templates
- Other Kinds of Templates
- Index
- About the Author
- Colophon
- SPECIAL OFFER: Upgrade this ebook with OReilly
O'Reilly Media - inne książki
-
Keeping up with the Python ecosystem can be daunting. Its developer tooling doesn't provide the out-of-the-box experience native to languages like Rust and Go. When it comes to long-term project maintenance or collaborating with others, every Python project faces the same problem: how to build re...(203.15 zł najniższa cena z 30 dni)
203.29 zł
239.00 zł(-15%) -
Bringing a deep-learning project into production at scale is quite challenging. To successfully scale your project, a foundational understanding of full stack deep learning, including the knowledge that lies at the intersection of hardware, software, data, and algorithms, is required.This book il...(237.15 zł najniższa cena z 30 dni)
244.53 zł
279.00 zł(-12%) -
Frontend developers have to consider many things: browser compatibility, usability, performance, scalability, SEO, and other best practices. But the most fundamental aspect of creating websites is one that often falls short: accessibility. Accessibility is the cornerstone of any website, and if a...(202.60 zł najniższa cena z 30 dni)
202.55 zł
239.00 zł(-15%) -
In this insightful and comprehensive guide, Addy Osmani shares more than a decade of experience working on the Chrome team at Google, uncovering secrets to engineering effectiveness, efficiency, and team success. Engineers and engineering leaders looking to scale their effectiveness and drive tra...(116.53 zł najniższa cena z 30 dni)
116.48 zł
149.00 zł(-22%) -
Data modeling is the single most overlooked feature in Power BI Desktop, yet it's what sets Power BI apart from other tools on the market. This practical book serves as your fast-forward button for data modeling with Power BI, Analysis Services tabular, and SQL databases. It serves as a starting ...(202.78 zł najniższa cena z 30 dni)
202.28 zł
239.00 zł(-15%) -
C# is undeniably one of the most versatile programming languages available to engineers today. With this comprehensive guide, you'll learn just how powerful the combination of C# and .NET can be. Author Ian Griffiths guides you through C# 12.0 and .NET 8 fundamentals and techniques for building c...(245.09 zł najniższa cena z 30 dni)
244.59 zł
279.00 zł(-12%) -
Learn how to get started with Futures Thinking. With this practical guide, Phil Balagtas, founder of the Design Futures Initiative and the global Speculative Futures network, shows you how designers and futurists have made futures work at companies such as Atari, IBM, Apple, Disney, Autodesk, Luf...(150.10 zł najniższa cena z 30 dni)
150.00 zł
179.00 zł(-16%) -
Augmented Analytics isn't just another book on data and analytics; it's a holistic resource for reimagining the way your entire organization interacts with information to become insight-driven.Moving beyond traditional, limited ways of making sense of data, Augmented Analytics provides a dynamic,...(178.05 zł najniższa cena z 30 dni)
177.85 zł
209.00 zł(-15%) -
Learn how to prepare for—and pass—the Kubernetes and Cloud Native Associate (KCNA) certification exam. This practical guide serves as both a study guide and point of entry for practitioners looking to explore and adopt cloud native technologies. Adrián González Sánchez ...
Kubernetes and Cloud Native Associate (KCNA) Study Guide Kubernetes and Cloud Native Associate (KCNA) Study Guide
(169.14 zł najniższa cena z 30 dni)177.65 zł
199.00 zł(-11%) -
Python is an excellent way to get started in programming, and this clear, concise guide walks you through Python a step at a time—beginning with basic programming concepts before moving on to functions, data structures, and object-oriented design. This revised third edition reflects the gro...(143.54 zł najniższa cena z 30 dni)
143.04 zł
179.00 zł(-20%)
Dzieki opcji "Druk na żądanie" do sprzedaży wracają tytuły Grupy Helion, które cieszyły sie dużym zainteresowaniem, a których nakład został wyprzedany.
Dla naszych Czytelników wydrukowaliśmy dodatkową pulę egzemplarzy w technice druku cyfrowego.
Co powinieneś wiedzieć o usłudze "Druk na żądanie":
- usługa obejmuje tylko widoczną poniżej listę tytułów, którą na bieżąco aktualizujemy;
- cena książki może być wyższa od początkowej ceny detalicznej, co jest spowodowane kosztami druku cyfrowego (wyższymi niż koszty tradycyjnego druku offsetowego). Obowiązująca cena jest zawsze podawana na stronie WWW książki;
- zawartość książki wraz z dodatkami (płyta CD, DVD) odpowiada jej pierwotnemu wydaniu i jest w pełni komplementarna;
- usługa nie obejmuje książek w kolorze.
Masz pytanie o konkretny tytuł? Napisz do nas: sklep[at]helion.pl.
Książka, którą chcesz zamówić pochodzi z końcówki nakładu. Oznacza to, że mogą się pojawić drobne defekty (otarcia, rysy, zagięcia).
Co powinieneś wiedzieć o usłudze "Końcówka nakładu":
- usługa obejmuje tylko książki oznaczone tagiem "Końcówka nakładu";
- wady o których mowa powyżej nie podlegają reklamacji;
Masz pytanie o konkretny tytuł? Napisz do nas: sklep[at]helion.pl.
Książka drukowana
![Loader](https://static01.helion.com.pl/ebookpoint/img/ajax-loader.gif)
![ajax-loader](https://static01.helion.com.pl/ebookpoint/img/ajax-loader.gif)
Oceny i opinie klientów: Bioinformatics Programming Using Python. Practical Programming for Biological Data Mitchell L Model (0)
Weryfikacja opinii następuję na podstawie historii zamówień na koncie Użytkownika umieszczającego opinię. Użytkownik mógł otrzymać punkty za opublikowanie opinii uprawniające do uzyskania rabatu w ramach Programu Punktowego.